台灣有基隆、高雄兩大郵輪母港，政府已投入10億改善基隆港的通關大樓、入出境大廳、立體廊道跟碼頭工程，預計2018年8月將獲初步改善，2019年全部竣工後，郵輪旅客可像搭飛機一樣舒適便利，郵輪可同時進出關。
現在基隆港可接待70萬人次旅客（不含掛靠），將來東碼頭可停靠一大（10幾萬噸）一中（7萬多噸）的郵輪，西碼頭可停靠一艘巨無霸（22萬噸級數）郵輪，總計可接待105萬人次。
軟體部分，東碼頭將結合當地特色、歷史與廟口文化，開發成文創園區；西碼頭則以日治時期、基隆嶼、水產等意象為設計主軸，藉此吸引未參加套裝行程的船上旅客，就近到基隆遊玩。
高雄港硬體部分，新港埠旅運中心預計2019年底完成，可同時停靠兩艘大郵輪，接待量將從12萬人次增至40萬人次；軟體部分，中央已編列27億經費，打造長3公里、串連蓮池潭與左營舊城的新園區，將融入廟宇文化，重現清朝時期的舊城區景致，再搭配輕軌捷運，吸引旅客到此一遊。
加緊改善軟硬體外，政府如能在不影響國家安全下，開放更多東協國家免簽，將提升外國人來台意願。
觀光局與港務公司將聯合行銷，鎖定鄰近台灣且國際旅客較多的國家如泰國及新加坡，以多母港操作方式吸引歐美旅客用Fly Cruise到台灣旅遊，並與亞洲各港口合作，共同擴大郵輪產業的規模。
