對於製造業而言，因新法規定每七天強制放假一天，這一天也不能加班，將造成調班困難。而若休息日加班，加班費將增加兩倍以上，也增加營運成本。在目前全球景氣並不樂觀的情況下，無異雪上加霜。
一家台灣工業電腦大廠人資長明言，工廠SMT線（表面零件黏著）原本是兩班制，為了應付旺季3～5月的急單時，將要轉成三班制，新法實施後，預計要增加10～15人。
但，很多外勞來台灣工作，就是想多加班賺點錢，但現在公司不希望員工休息日來加班，「最後可能導致這些外勞不想加入你的公司，」這位人資長擔憂將產生雪崩效應。
員工難調度，人事成本提高
聘雇6000多位員工的漢翔航空，自一例一休提出後，高層便與人事部門討論因應之道。
身處追求品質與交期的航太產業，漢翔航空董事長廖榮鑫指出，客戶的交期很硬，不是單方面能控制，所以不加班不可能。
按照一例一休的新規定，漢翔經過測算，每年約要增加的勞務成本為200萬新台幣。「其實還好，」廖榮鑫說，因為公司的毛利算高，尚能忍受這筆增加費用。
然而，看到同屬航太業的華航罷工風波，加上一例一休引發的爭端，廖榮鑫不禁憂心：「我只是覺得勞資會愈來愈對立，處理勞資爭議的挑戰也會愈來愈高。」