但當他接任天下第一大部——內政部長職位的消息曝光後，坊間卻出現了部分質疑聲音。銘傳大學公共事務系助理教授陳朝建大感跌破眼鏡，他認為李鴻源的專長為土木、水利，能否處理好消防、警政、兒童、社福等內政，打個問號？
不過，瞭解的人都知道李鴻源沒有一定把握不會應允。「外界不妨拭目以待他的表現，」身邊的友人肯定地說。
其實李鴻源與行政院長陳冲並無私交，但年初高層在物色新內閣成員時，已將他鎖定為內政部長人選。春節期間陳冲打電話邀約入閣時，讓他十分訝異：我有沒有聽錯，你是不是講錯了？一個鐘頭後，他回覆：願意。
而讓他接手內政部的理由是過去擔任台北縣副縣長所管轄業務與內政部相仿，只是一個是執行單位，一個是政策制定單位。而且國土規畫與防災、土木水利都是專長，就像他自動請纓處理高鐵問題，沒有六、七成把握，絕不輕言接任。
「我會考量到底能不能勝任，如果無法完成任務，不會隨便答應，」他再三強調，「否則會耽誤到國家正事」。
新人新政：優先處理國土、防災與居住
其實，當所有新閣員還在遲疑、閃躲媒體時，李鴻源將就任任政部前夕，就大方接受邀訪，與其他首長形成鮮明對比。而且他對許多議題侃侃而談，讓外界頗為意外。
他笑著說，教授當久了，懂得如何抓重點。每當接下新職，都會定下旗艦計畫激勵士氣，讓同仁養成Coordinate（動詞，去協調）的習慣，進而形成Coordination（名詞，協調）的文化。 現在更加快腳步，要訂出內政部幾大亮點，而國土規劃、防災防洪救助與居住正義等等，都是優先項目之一。
以國土規畫為例，躺在立法院多年的國土計畫法是超級燙手山芋，由於牽涉到選票，朝野政黨都不敢讓法案輕易通過。他心裡有數，依照過去的方式，再躺個100年也過不了關。
他決定以科學為支撐，化解各界疑慮，凝聚全民共識。李鴻源說，政府不能只告訴民眾某個海拔以上的區域不能住人，卻不充分說明以及解決搬遷等後續問題。防災與國土計畫是一體的兩面，過去各作各的，現在要將全國災害顯示圖與台灣的地圖套疊起來，就能找出高危險、警戒或較不危險的地區。高危險地區民眾一定要搬遷，但必須有配套措施，警戒區可以住人，不過必須做好預警系統。
「左手有國土計畫法、右手有防災顯示圖，誠心誠意用民眾聽得懂的話溝通，」李鴻源相信一定可以找到打開鎖頭的鑰匙。
而年輕人最在意的房價與居住問題也有了腹案。他承諾不會打房也不會盲目蓋平價住宅，歡迎陸資投資公共建設，卻不鼓勵陸客炒作房地產。
再過幾年，當機場捷運等交通網絡完工後，從台北到中壢、八里、淡水都可在半個鐘頭內到達。他希望將居住空間概念擴充到外圍城鎮，開發出新市鎮後，民眾可透過低利貸款購屋，等到新市鎮發達後，台北房價自然下降。至於沒有能力購屋的人，可以用社會福利、社會住宅方式協助。
另外，他還想連貫工程、水利與營建等環節，推動新的建築法規，要求建商施工時要考慮排水、集水，確保水資源都能滲透到地底，讓全國土地達到最佳的利用與保養狀態。
協調規劃中央和地方四成重疊的業務
可以預期的是，業務包羅萬象的內政部想推動任何政策，一定會牽涉到其他部會。有過跨部會協調經驗的李鴻源決定主動與相關部會合作，例如農委會的農地釋出、國科會的科學園區用地等問題。
當然，地方政府繁雜的業務也是不可迴避的問題。尤其是五都成立後，大台中、台南、高雄根本還未做好準備，光有直轄市的美麗稱號，卻無實質內涵，已演變成地方首長天天向中央要錢、要人。
「就算中央真得給了地方很多錢與人，仍然解決不了問題，」李鴻源憂心地說，中央與地方有四成的業務重疊，不符合國家利益，這些雖不全然是內政部的事，還是要有人去規範，內政部也會盡量協助地方建立起自己的能力。棘手的是，這又是政治敏感議題，操作起來得異常謹慎才行。
回顧李鴻源的公職生涯宛如「解習題」的馬拉松競賽，解完一題又來一題，這次雖然已看到國土規畫更深層的課題，卻還沒有找到答案，「我會很努力地將一個個結打開來，」他期許自己。
