可確定的是，2003年源於墨西哥的H5N2低致病性病毒入台，但卻留在台灣達十多年。「已經在地化，」中興大學動物科學系名譽教授李淵百表示。
的確，2015年台灣就出現H5N2高病原，病毒已變異，且愈來愈嚴重。當時撲殺了543萬隻家禽，至今台灣仍在它魔掌下，「2015年的H5N2高致病性，已成了台灣禽流感病毒的特有種！」中研院生醫所兼任研究員何美鄉表示，它還混合了來自墨西哥、亞洲的病毒基因。
鴨子染病不發病 難追蹤
為了找到病毒可能藏身處，農委會今年首次全面清查鴨場。經由獸醫確定，鴨子健康無虞，才能送屠宰場。儘管遭鴨農抗議，卻真的查到了帶有H5N2、H5N8病毒的鴨子。「鴨子保毒！」農委會官員如此表示，他們從過去疫情發現，病毒可能藏在鴨子體內。由於鴨子具有染病不發病的特性，外觀如常，糞便卻帶有病毒，會傳染其他家禽。
需要加強教育的還有農民，他們容易輕忽疫情。今年2月上旬，台南市一名火雞場飼主懷疑飼料引發3800隻火雞死亡，與飼料商發生爭執，動保處得知後前往訪視、採樣，才發現是H5N6作祟。
台大獸醫系教授周崇熙也表示，過去農民不知道鵝會死於禽流感。2015年，有農民看到鵝的眼睛四周充血，誤以為有人下毒，不久發現其他人的鵝也被「下毒」，通報檢驗後，才知道是禽流感。
政府須拿出更積極的措施
每逢疫情，總有農民罔顧安全衛生，暗中丟棄病死家禽，凸顯不負責任的逃避心態。防檢局發現，其中不少人沒有合法登記證，無法領取撲殺補償費，因此企圖隱匿疫情。
「農民這樣丟棄，是嫌復養申請麻煩，」一名農民表示。家禽界流傳著公開的祕密：有些人死了雞鴨鵝，寧可吞下損失，不願主動通報。「家禽健康和人息息相關，」台大流行病學與預防醫學研究所教授金傳春就感嘆，台灣的公共衛生水準舉世聞名，醫療單位防制人類傳染病，堪稱亞洲先鋒，但對動物疫病的重視卻遠遠不及。
為了禽流感，官員與學界都捲入風暴
細數台灣的傳染病，大概沒有一個疾病，會像禽流感這樣充滿戲劇性的恩怨情仇。它不僅讓農委會高層官員被外界揭發隱匿疫情，遭監察院彈劾、調職，也讓想要了解病毒是否在地化的學者，被農委會開罰，研究受阻。
回溯2012年，紀錄片導演李惠仁拍攝《不能戳的祕密》，指控當時的農委會主委陳武雄、副主委王政騰和防檢局局長許天來隱匿疫情。監察院調查發現，2009年，王政騰接受好友請託，沒有通報高致病禽流感，意圖私了疫情，許天來則涉及違法關說。
同一時間，多次力勸農委會以科學防疫的台大流行病學與預防醫學研究所教授金傳春向農委會申請，到台北市家禽批發市場採樣，檢驗血清抗體及病毒。不過，防檢局誤認為她的實驗室是同時進行人流感病毒與禽流感病毒，卻發公文自此禁止學界從事相關研究。
金傳春只好和香港大學合作，後來發表所採血清有八成以上具H9N2禽流感抗體，病毒已經在地化。當時防檢局連續兩天發布新聞稿反駁還處罰她，罰款兩萬元。但她仍建議政府應採新思惟防疫。
今年防檢局發現H5N6，立即撲殺，相較於2015年，某些縣市在發現異狀後四天，才接到撲殺命令，手法明快許多。官員現在也接受專家建議，在發現疫情12天後，實施禁宰禁運七天，不致全台延燒。
據中研院生醫所兼任研究員何美鄉觀察，家畜衛生試驗所過去檢驗病毒需要四天，今年縮短到兩天；從前，專家會議不對外開放，今年則是臉書直播，都是明顯進步。
就連被罰款的金傳春也肯定農委會與行政院找專家學者提供防疫建議。她更期盼改善禽流感偵測，整合病毒序列與臨床數據，並且快速公布，即時分析結果，提升防疫效能，降低禽農損失。
