誰是這次國是會議最大的贏家？是民進黨？是李總統？是台灣老百姓？似乎任何判斷都言之過早，一切還要看會後台灣島內的各種演變，更不可忽略海峽對岸中共的反應。
從台北或北京來看，國是會議中，民進黨以及支持民進黨理念的一些學者，所提出的主張，已經使「台灣獨立」的藍圖清清楚楚地露出了檯面。撇開一些學理上的爭辯，這些主張包括了：
(一)把台灣省畫出四省到六省，省長由人民投票產生。
(二)總統也由台灣的人民直接投票產生。
(三)重大的改革由公民投票來決定。
(四)國民大會、監察院、考試院均應廢除，立法院變成所謂單一國會。
(五)資深的國大代表、立法委員、監察委員應立刻退休；總統民選要儘快舉行。
(六)國是會議後設立憲政推動及監督小組，變成超國會的機構。
按照這些主張，剝掉美麗的彩衣，事實上否定了中華民國的憲法。中華民國的台灣就變成了新台灣國；總統制，也因為老代表的退休，切斷了與大陸的象徵關係。同時，在台灣安全前提下，與大陸保持冷淡的交流。
激進下的社會成本
國是會議中大部分的國民黨代表及另一些學者，考慮到激進改革帶來的社會成本，則認為：
(一)把台灣已有的二個院轄市，增加到四個或五個，台灣仍是一省。