12年國教的入學管道分為免試與特色招生兩種。
特色招生的學校與比例是地方政府與教育部要解決的問題，對於決定要參加特色招生的學生來說，就是術科甄選與考試分發兩種，與現在的多元升學方式相同。
例如想念體育特色招生班的學生，就要透過體育的術科考試以及社團經驗、得獎紀錄向學校申請，另外學科的特色招生，例如數理資優班，都是要看特色招生考試的成績，差別只在於要報考哪個就學區，例如基北區（包括基隆市、台北市、新北市）或中投區（包括台中市、南投縣）。
較為棘手的是75％的適性輔導免試入學，屆時一定會有登記人數超過免試招生名額的情況，不只公立高中職，就連私立高中職也會發生，因為私校也有明星學校，而高職也有熱門與非熱門的科別。
目前各校可以按照教育部規定辦理免試入學，是因為都以學生在校成績為篩選標準，但12年國教後，不能採在校成績，該如何決定哪些學生才適合呢？
上有免試入學 下採會考成績
難怪北一女校長張碧娟直言，免試入學比例看似可以從今年的40％增加到明年的55％，事實上，現在的「進度等於零」。
因為北星計畫或北北基聯合擴大免試，都是採在校或考試成績。以後完全不採納成績，要怎麼樣招生？
不過《遠見》根據第一線採訪，歸納出103年地方政府初步規劃會採取的入選辦法。
以全國最重要的就學區北北基為例，報名人數少的學校，毫無問題全部錄取；招生容量比不相上下的學校，會傾向用抽籤方式；至於報名學生超過的學校，則會根據國中三年的性向、興趣測驗、適性輔導、教學評量作為基礎；再來是社團經歷與比賽成果，例如申請美容美髮科，如有美髮比賽得獎紀錄，可作為比序條件，最後還有三年級的會考成績，綜合三項考量決定。
不只基北考區研擬出這樣的免試入學辦法，連桃園、新竹、台中、高雄等主要考區幾乎都有志一同。
高雄市教育局長蔡清華坦承，雖然教育部推動的高中職優質化與均質化政策已出現成果，還是無法說服家長每所學校都是均優的，這些累積數十年的明星學校在家長、學生心中自有排序。「所以103年時，免試入學的部分，還是會採用會考成績，」蔡清華說，畢竟考試還是比較公平的制度，也會再添加一些加分的特殊項目，至於是哪些項目，會在考試前一年定案宣布。
而桃園縣教育局長林逸青也傾向採用會考成績，不過一定會以學生的權益為優先考量。她強調將以專業、誠意與各界溝通後，制訂出較為公平的遊戲規則。
