台灣國內債券型基金於2001年6月正式突破兆元大關，一年半來，迅速倍增到新台幣1.9兆元，相當於台灣全年國民生產毛額每5元就有1元放在債券基金。如此龐大的金額，驚動了主管機關中央銀行與財政部，央行已經要求證期會嚴格控制債券基金發行規模，財政部則快速取消了基金免稅優惠。
財政部原本的制度是投信公司把債券基金收益分配給投資人，財政部再把預扣的10％所得稅退還給債券基金，可是投信為了替客戶節稅，都沒有把收益分配出去，又拿了10％退稅，在稅賦上並不公平。因此從1月份開始，債券基金投資在定存和公司債的收益不再退稅。
這個改變經過國內債券基金前三大發行公司英商保誠投信、群益投信與荷銀光華投信評估，對業者的擊並不大，荷銀光華固定收益資產管理部副總經理薛秋香估計，財政部頂多只能收到40億元，與1.9兆元相比，根本是小之又小，所以對投資人的影響相當有限。
不過，事情才剛開始，財政部還有第二種作法，就是對債券基金的收益分離課稅，而且連最後一個投資標的——債券附買回（RP）的收益都要課稅。