引發「五二０」知識界、學運團體、社運團體及反對力量聯手走上街頭，造成一場社會動盪的「獨台會案」，已逐漸風平浪靜，政壇、校園、街頭都恢復正常運作。然而，它對台灣政治生態的影響，才剛開始。
在這次獨台會案中，政府低姿態應對；迅速交保涉案四青年；明快廢止「懲治叛亂條例」；警方在遊行現場採取柔性措施，都是事件能平和收場的重要原因。
不過，這次事件也有重要的指標作用。它吸納了知識界、學生、婦女、環保等團體及民進黨。其中包括極端的台獨派，色彩鮮明地要求「台獨結社權」；統派人士也加入遊行陣容，以「反對白色恐怖」為訴求；外省籍的大學教授和來自南部鄉間的草根群眾，在不同的立場、相同的口號下，走在同一個示威隊伍中。這是歷來台灣動員範圍最廣、成員最複雜的街頭示威活動。
「獨台會案」能凝結形形色色的社會力量，共同走上街頭，具有以下幾點意義：
一、對「人權」的重視。
民進黨於四月十七日以反對老賊修憲為主題，發起街頭示威，動員人數雖多，但對社會的衝擊有限，因為它的參與群眾是固定的一群人，而「五二０」的成員廣泛，其中包括一些有社會公信力的人。
不同立場、不同利益、不同出身背景的人願意暫時放棄歧見，一同行動，主要在反對情治機關以政治原因，侵入校園逮捕學生，和警察以粗暴行為對付知識分子。
擁郝？反郝？
二、對政治改革名實不符的不耐。
動員戡亂時期宣告終止，執政黨及李總統都視之為對國家的巨大貢獻，但實際上，動員戡亂時期的法制則未見檢討，諸如國安法、集遊法、選罷法仍依循舊制，從嚴限制。獨台會案，涉嫌人依唯一死刑法條移送法辦，激起反彈，更證實情治機關仍依動員戡亂心態辦案。
三、對郝柏村院長強勢作為的「恐懼」。
郝院長就任一年來，確實展現了強人風格，整頓治安、查緝走私、平復工潮，五輕也順利動工，大力提振公權力，民意測驗郝院長聲望節節升高。此時爆發獨台會案，適巧郝院長對外蒙問題的觀點，與李總統先前在記者會中的宣布迥異，引起民間的疑慮，擔心強人院長聲勢勝過李總統，反郝波濤遂起。
郝院長的作風使他得到民間的支持，也使得反對他的人態度堅決。
李郝維持動態平衡
「五二０」這次行動，顯示台灣的政治發展將邁向一個新的境界，權威解體、社會多元、政治運作更為開放。簡單而言，未來的可變動性將會更大：
．就兩岸關係而言：懲治叛亂條例廢止後，共產黨員入境的法律限制業已解除，境管局雖然仍將以行政命令規範，但可以預期大陸人士入境台灣，將愈來愈順暢，兩岸互動更為頻繁。
．就統獨問題而言：懲治叛亂條例廢止，刑法一００條普通內亂罪面臨廢止或修正的壓力，國安法禁止分裂國土的規定也要重新檢討。境管局限制異議人士人境措施必須放寬或取消，情治機關未來偵辦政治案件態度必須更慎重，手段必須更節制。
當台獨的活動空間日益擴大時，共產主義也可能獲得發展空間。
民意調查基金會定期對台灣地區居民做台獨意向的調查，最近一次在去年十二月舉行，贊成台獨的受訪者約一二%，與過去歷次調查接近。其他民意調查的結果也相當類似，大致都不超過一五%。而新國家連線候選人的選票也在一五%左右，他們雖是人口中的少數，但活動力強、衝擊力大。台獨力量繼續擴大後，島內反台獨的社會階層及中央回應姿態會不會相對提高？未來將更不可預測。
．就朝野關係而言：台灣政治愈民主開放，民進黨的活動空閒愈擴大。獨台會案引發的「五二０事件」，民進黨雖因執政黨審慎應對而未能獲得太多的政治利益，但民進黨仍會有許多機會給執政黨出難題，兩黨競爭激烈態勢有增無減。
．就府院關係而言：五二０充分顯示，郝院長掌握實權、聲望崇隆，而支持李總統的民氣也可用，雙方各有籌碼。李郝體制必須維持動態平衡。這次內閣局部改組，兩人相互磋商，彼此尊重的運作模式再次成功。不過，既是動態平衡，也就充滿可變性。
更不安定的未來
許多人期待，台灣趕快走過「過渡期的陣痛」，重歸安定，但情勢都顯示，台灣仍繼續面對一個快速變遷，不太安定的環境。台灣應如何面對持續的不安定呢？
一、建立一個充分民主化的政治結構及法律體系。
台灣歷經四十年的選舉，人民普遍支持民主的價值，很多人雖然反對台獨，但政府如果以違反民主原則的手段與台獨對抗，社會是否接受，就值得再三斟酌。「獨台會案」就是一個例子。
因此，政府必須加速檢討動員戡亂時期的法律制度，如國安法、選罷法、集遊法都應重新檢討立法宗旨及條文，國家總動員法等非常態立法亦須檢討。
此外，政府亦應規畫對公務員、情治人員展開全面講習，訓練公務員及情治人員的民主理念，使他們更能適應民主開放的政治環境。
另一方面，民進黨如果真的要走上「執政之路」，也必須認同民主理念，發揮寬忍精神，尊重「反台獨」的自由。否則，民進黨終將遭多數選民揚棄，自絕「執政之路」。
二、重新架構充分開放的政治競爭規則。
台灣「一黨獨大」制度運作已四十年，未來改變的可能性不大，但政府仍必須規畫建立政黨輪替執政的法規制度。唯有如此，朝野競爭才能制度化，潛藏在社會各角落的不滿者，才能在體制內充分表達意見，避免「擦槍走火」的可能性。
三、建立「整合」的文化觀。台灣已由一元的權威型社會蛻變為多元的開放型社會，多元而未整合，將使社會逐漸疏離，衝突頻生。民主社會不能僅止於尊重多元價值與利益，還必須有意願、能力整合多元價值與利益。
如何培養整合的意願及能力，應是台灣現階段重要的課題。
